Формальной датой завершения деятельности арбитража следует назвать 1 октября 1991 г. В Постановлении Верховного Совета РСФСР от 04 юля 1991 г. «О введение в действие Закона РСФСР «Об арбитражном суде» указывалось: «Упразднить с 1 октября 1991 года на территории РСФСР арбитраж и иные аналогичные органы в системах министерств, государственных ведомств, в ассоциациях, концернах, а также на предприятиях и организациях…». Реформирование судебной системы началось с принятием Закона РСФСР от 4 июля 1991 г. N 1543-1 "Об арбитражном суде", вступившего в силу 1 октября 1991 г.
Народный суд со дня образования до 1960 года являлся участковой системой, т.е. назывался народный суд первого и второго участка, а с 1 января 1960 года объединили в один районный народный суд, других изменений в структуре суда по настоящее время не было.
За последние годы сделан заметный шаг в организационном, материально-техническом обеспечении суда, компьютеризации, существенном расширении гласности, создан сайт Чишминского районного суда. Много сделано по обеспечению всего коллектива необходимой оргтехникой.
Штат суда состоит из 15 человек: 3 судьи, 2 помощника судьи, 3 секретаря судебных заседаний, секретарь суда, специалист 1 разряда, 3 сторожа, уборщица служебных помещений, водитель.
Указом президента РФ от 13 ноября 2014 года № 719 председателем Уфимского гарнизонного военного суда назначен Страхов Владимир Евгеньевич, на 6-летний срок полномочий, который ранее занимал должность председателя Оренбургского гарнизонного военного суда.
С 04 августа 2009 года председателем Уфимского районного суда Республики Башкортостан назначен Садыков Рамзиль Наилевич. В настоящее время в районном суде г. Уфы отправление правосудия осуществляют 7 судей.
С введением в 2001 году института мировых судей изменена подсудность Учалинского районного суда (ряд дел в соответствии с законом передан в ведение мировых судей), восстановлена участковая система рассмотрения дел мировыми судьями. Учалинский районный суд является апелляционной инстанцией по отношению к мировым судьям.
В настоящее время Туймазинский районный суд РБ размещен в 2-х этажном здании 1954 года постройки, общая площадь которого составляет 462,9 кв.м. Здание передано в Управление Судебного департамента в Республике Башкортостан в безвозмездное пользование на основании договора №7 от 04.09.2003 года.
В настоящее время Стерлибашевский межрайонный суд Республики Башкортостан является пятисоставным (председатель суда и судьи). Аппарат суда состоит из 14 сотрудников. В состав суда также входит сотрудники тех. персонала. Всего в коллективе суда работает 33 человека.
В настоящем Стерлитамакский городской суд Республики Башкортостан является крупнейшим городским судом республики, штатная численность судейского корпуса составляет двадцать семь судей – это высокопрофессиональные и квалифицированные юристы, добивающиеся хороших показателей в судебной практике.
