Губкинский районный суд начал свою деятельность 1 января 1999 года. До этого момента дела рассматривались Пуровским районным судом, часть которого, включая председателя Птицину Н. М. и судью Ветлугина С. В., размещалась на территории г. Губкинского. Первым председателем Губкинского районного суда стала Татьяна Алексеевна Мякишева, до этого трудившаяся в Пуровском районном суде.