Все судьи Фокинского гарнизонного военного суда активно претворяют в жизнь положения судебной реформы. Взаимодействуют с правоохранительными органами и командованием воинских частей, ведут напряжённую работу по оперативному и законному реагированию на преступления и правонарушения, в строгом соответствии с установленными федеральными законами правилами судопроизводства разрешают судебные дела.
До 2001 года председателем суда являлся Кадкин Андрей Александрович, а далее до апреля 2016 года председателем суда была Цветкова Татьяна Финиесовна. С апреля 2016 года по настоящее время председателем суда является Индиченко Павел Николаевич.