С 1991 года суд переехал в двухэтажное здание общей площадью 430 квадратных метром по адресу ул. Ленина дом 2. Состав суда был уже пяти составным: председатель суда Моисеев Леонид Васильевич, Кулакова Галина Николаевна, Королев Валентин Иванович, Мельникова Вера Валентиновна, Шестаков Леонид Михайлович. В 2002 году Богучанский районный суд переехал в более просторное здание по адресу ул. Партизанская дом 113, общая площадь здания 830 квадратных метров. В данное время в суде работают семь федеральных судей и два мировых судьи.