С 1 января 2012 года вступили в действие поправки, внесенные в Гражданский процессуальный кодекс РФ. В суде Еврейской автономной области начала работу апелляционная инстанция по рассмотрению гражданских дел. С 1 января 2013 года - апелляционная инстанция по уголовным делам. В 2015 году начала работу судебная коллегия по административным делам.
Суд рассматривает в качестве суда первой инстанции все гражданские, уголовные дела и дела об административных правонарушениях за исключением дел, подсудных другим судам, и в качестве суда апелляционной инстанции – гражданские, уголовные дела и дела об административных правонарушениях, рассмотренные мировыми судьями, по апелляционным жалобам и представлениям.
Ленинский районный суд в пределах своей компетенции рассматривает дела в качестве суда первой и второй инстанции и осуществляет другие полномочия, предусмотренные федеральным конституционным законом, является непосредственно вышестоящей судебной инстанцией по отношению к мировым судьям, действующим на территории Ленинского муниципального района ЕАО, Октябрьского муниципального района ЕАО.
679014, ЕАО, г. Биробиджан, ул. Трансформаторная, д. 3 А
За время работы Биробиджанского гарнизонного военного суда, служащие суда и судьи неоднократно поощрялись руководителями вышестоящего суда, и их весомый вклад военно - судебную систему бесспорен.
С 1 июня 2018 года, в соответствии с изменениями в российском законодательстве, в районных судах Российской Федерации началось рассмотрение уголовных дел с участием присяжных заседателей. В Биробиджанском районном суде ЕАО первый такой процесс состоялся в марте 2019 года.
Арбитражный суд Еврейской автономной области образован решением областного Совета народных депутатов от 16 октября 1991 года в соответствии с Законом РСФСР «Об арбитражном суде». Еврейская автономная область ранее входила в состав Хабаровского края, в связи с чем все экономические споры разрешались в Государственном арбитраже при Исполнительном комитете Хабаровского краевого Совета народных депутатов. Поэтому, в отличие от других регионов, где суды создавались на базе органов государственного арбитража, в ЕАО возможностей по созданию арбитражного суда, подготовке помещения, подбору судей и специалистов было значительно меньше.