До 1982 года Онежский городской суд был двухсоставным. В 1982 году была введена третья единица судьи. В 1987 году была введена четвертая единица судьи. В 1994 году была введена пятая единица судьи. На сегодняшний день Онежский городской суд является пятисоставным. На 1 марта 2019 года в Онежском городском суде работает 23 сотрудника.